blast下载
时间: 2025-06-30 17:13:52 浏览: 12
BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)是由美国国家生物技术信息中心(NCBI)开发的一套广泛用于生物序列比对的工具集。它主要用于比较蛋白质或核酸序列,以寻找数据库中的相似序列[^2]。
### 下载 BLAST 工具
1. **标准 BLAST**
标准 BLAST 可以从 NCBI 的 FTP 站点下载。用户可以根据操作系统选择合适的版本(Windows、Linux 或 macOS)。
- 官方下载地址:[https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/](https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/)
- 该链接提供的是 `blast+` 套件,包含命令行版本的 BLAST 工具,例如 `blastn`, `blastp`, `blastx` 等。
2. **SMART-BLAST**
SMART-BLAST 是标准 BLASTp 的简化版,适合快速查找与输入序列高度相似的蛋白质序列。它可以通过 NCBI 的网页界面直接使用,无需下载安装。
- 网页地址:[https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PROGRAM=blastp&PAGE_TYPE=SmartBlast](https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PROGRAM=blastp&PAGE_TYPE=SmartBlast)
3. **BLAST+ 命令行工具**
如果需要在本地运行 BLAST,建议下载并安装完整的 BLAST+ 套件。安装完成后,可以使用命令行执行 BLAST 查询,例如:
```bash
blastp -query input.fasta -db nr -out results.txt
```
此命令将使用 `nr` 数据库对 `input.fasta` 文件中的蛋白质序列进行比对,并将结果保存到 `results.txt` 中。
4. **其他相关工具**
- **CD-HIT**:一个快速的蛋白质或核酸序列聚类工具,适用于大规模数据集的处理[^3]。
- **UCLUST**:基于 USEARCH 的贪婪算法,用于高效地对序列进行聚类和比对[^3]。
### 安装步骤(以 Linux 为例)
1. 从上述 FTP 地址下载适用于 Linux 的压缩包,例如 `ncbi-blast-2.xx.0+-x64-linux.tar.gz`。
2. 解压文件:
```bash
tar -zxvf ncbi-blast-2.xx.0+-x64-linux.tar.gz
```
3. 将解压后的 `bin` 目录添加到系统环境变量中:
```bash
export PATH=$PATH:/path/to/ncbi-blast-2.xx.0+/bin
```
4. 验证安装:
```bash
blastp -version
```
完成以上步骤后,即可在本地环境中使用 BLAST 工具进行序列比对。
---
阅读全文
相关推荐


















