mat格式转nii格式python代码
时间: 2025-02-27 11:37:59 浏览: 70
### 将MAT文件转换为NII格式
为了实现从MAT文件到NII格式的转换,可以利用`scipy.io`加载MAT文件并使用`nibabel`创建和保存新的NIFTI图像。下面展示了具体的方法:
#### 加载MAT文件数据
首先,通过`scipy.io.loadmat()`函数来读取存储在MAT文件中的数组。
```python
import scipy.io as sio
# Load .mat file
data_file = 'example.mat'
mat_contents = sio.loadmat(data_file)
# Extract the array from mat contents; assuming it's named 'imageData' within MATLAB structure.
array_data = mat_contents['imageData']
```
#### 创建Nifti1Image对象
接着,构建一个`Nibabel.Nifti1Image`实例,这需要提供原始数据以及仿射变换矩阵(通常情况下如果不知道具体的坐标系映射关系,则可以用单位阵表示)。
```python
import nibabel as nib
import numpy as np
affine_matrix = np.eye(4) # Identity matrix used when no specific affine is available.
ni_img = nib.Nifti1Image(array_data, affine=affine_matrix)
```
#### 保存为.nii.gz或.nii文件
最后一步就是调用`.to_filename()`方法指定目标路径名及其扩展名(.nii 或者 .nii.gz),从而完成文件写入操作。
```python
output_nii_path = "converted_image.nii"
ni_img.to_filename(output_nii_path)
print(f"Converted and saved to {output_nii_path}")
```
上述过程假设MATLAB变量名为'imageData',实际应用时应替换为此处提到的具体名称[^2]。
阅读全文
相关推荐

















