pymol下载conda

<think>我们正在处理用户关于通过conda安装PyMOL的问题。用户希望了解如何通过conda下载并安装PyMOL。根据提供的引用，我们可以总结出几种安装方法，并注意可能遇到的问题。从引用中，我们得到以下信息：1.在Windows上安装时，用户按照某个版本下载，但在Ubuntu中创建的conda环境Python版本为3.7.12（引用1）。2.安装步骤包括创建conda环境，然后依次安装numpy、mkl、pmw，最后安装pymol-open-source（引用1）。3.在Ubuntu或Mac(M1)上安装的步骤：创建一个空的conda环境，然后使用conda-forge安装pymol-open-source（引用2）。4.在Windows上安装时可能会遇到DLL加载失败的错误（引用3），并提供了解决方案（但引用3的解决方案部分未完整给出，我们可以根据经验或后续步骤提供建议）。5.引用4提到了在WSLUbuntu中安装conda以及连接PyMOL的内容，但用户的问题主要是安装，所以我们可以参考其中的conda安装部分。因此，我们可以为不同操作系统提供安装指南。由于用户没有明确操作系统，我们分别提供Windows和Linux（包括Ubuntu和WSL）的安装方法。注意：PyMOL有两个版本：商业版和开源版。用户要求通过conda安装，这里我们安装开源版本（pymol-open-source）。安装步骤：1.创建并激活一个conda环境（推荐，以避免与其他包冲突）：```condacreate-npymol_envpython=3.7#引用1中环境为3.7.12，我们可以指定3.7版本，或者使用较新的版本（但需注意兼容性）condaactivatepymol_env```2.添加conda-forge通道（因为pymol-open-source在conda-forge上）：```condaconfig--addchannelsconda-forge```3.安装PyMOL：```condainstallpymol-open-source```但是，引用1和引用2的步骤略有不同。引用1在安装pymol-open-source之前先安装了numpy,mkl,pmw。实际上，conda在安装pymol-open-source时会自动解决依赖，因此我们可能不需要手动安装这些。但是，如果遇到问题，可以按照引用1的步骤先安装这些依赖。对于Windows用户，如果遇到类似引用3中的DLL加载错误（ImportError:DLLloadfailed），这可能是由于环境问题或缺少VisualC++运行库。我们可以尝试以下解决方案：-确保安装了VisualC++RedistributableforVisualStudio2015、2017和2019（可以从微软官网下载）。-或者尝试在conda环境中安装vc库（如果使用conda）：```condainstall-canacondavc=14```然后重新安装pymol-open-source。另外，引用4中提到了在WSLUbuntu中安装conda，如果用户是在WSL中安装，可以参考Linux的安装方法。因此，我们分操作系统给出详细步骤：**Windows系统：**步骤1：创建conda环境```condacreate-npymol_envpython=3.7condaactivatepymol_env```步骤2：安装依赖（可选，如果直接安装PyMOL失败，可以尝试先安装这些）```condainstallnumpycondainstallmklcondainstallschrodinger::pmw#注意：schrodinger通道可能需要先添加```步骤3：安装PyMOL（从conda-forge）```condainstall-cconda-forgepymol-open-source```步骤4：如果步骤3失败并出现DLL错误，尝试安装vc库：```condainstall-canacondavc=14condainstall-canacondamsvc_runtime```然后重新安装pymol-open-source。**Linux系统（包括Ubuntu和WSL）：**步骤1：创建conda环境```condacreate-npymol_envpython=3.7condaactivatepymol_env```步骤2：安装PyMOL（从conda-forge）```condainstall-cconda-forgepymol-open-source```注意：在Linux系统中，如果遇到图形界面问题，可能需要安装一些系统依赖库（如OpenGL等），但conda通常会处理这些依赖。安装完成后，可以通过以下命令启动PyMOL：```pymol```最后，根据用户的需求，我们生成相关问题。注意：以上步骤参考了提供的引用，但实际安装可能因系统环境而异。如果遇到问题，请检查错误信息并搜索解决方案。</think>### 通过 Conda 安装 PyMOL 的完整指南 #### 🐍 安装步骤： 1. **创建独立 Conda 环境**（避免依赖冲突） ```bash conda create -n pymol_env python=3.7 # 推荐 Python 3.7 版本[^1] conda activate pymol_env ``` 2. **安装必要依赖** ```bash conda install numpy mkl schrodinger::pmw # 核心数学库和界面库[^1][^3] ``` 3. **安装 PyMOL 开源版** ```bash conda install -c conda-forge pymol-open-source # 官方开源版本[^1][^2] ``` #### ⚠️ 常见问题解决方案： 1. **Windows DLL 加载失败**（引用3中的报错） - 安装 Microsoft Visual C++ 可再发行组件包（最新版） - 尝试： ```bash conda install -c anaconda vc=14 # 修复 DLL 缺失问题[^3] ``` 2. **Ubuntu/WSL 图形界面问题** ```bash sudo apt install libgl1-mesa-glx # 修复 OpenGL 依赖 export DISPLAY=:0 # WSL 需设置显示接口[^4] ``` 3. **Python 版本兼容性** - 严格使用 Python 3.7.x（更高版本可能导致库冲突）[^1] #### ✅ 验证安装： ```bash pymol # 启动后看到 PyMOL 图形界面即成功 ``` #### 💻 跨平台说明： | 系统 | 关键步骤 | 注意事项 | |------------|------------------------------|--------------------------| | **Windows**| 安装 VC++ 运行时库 | 避免使用管理员权限安装 | | **Ubuntu** | 安装 OpenGL 依赖 | 检查显卡驱动兼容性 | | **WSL** | 设置 `DISPLAY` 环境变量[^4] | 需搭配 X11 服务器（如 VcXsrv）| > 安装后建议冻结环境：`conda list --export > pymol_requirements.txt`