``` import pandas as pd import numpy as np data = pd.read_csv('TCGA_InfoWithGrade.csv')```将读取的数据第三列由连续值改为离散值,给出完整代码
时间: 2024-12-30 19:37:47 浏览: 37
要在Pandas中将数据的连续第三列转换为离散值(通常指分类或分桶),可以使用`pd.cut`函数对数据进行切分,并创建一个新的列。假设你想将第三列按照区间划分成几个类别,这里是一个示例代码:
```python
import pandas as pd
import numpy as np
# 读取CSV文件
data = pd.read_csv('TCGA_InfoWithGrade.csv')
# 假设我们想将第三列 'Column_3' 分为5个等宽区间
column_to_bucket = 'Column_3' # 替换为你实际的列名
num_buckets = 5
# 确定每个区间的边界,这里是等宽度的
bucket_boundaries = np.linspace(data[column_to_bucket].min(), data[column_to_bucket].max(), num_buckets + 1)
# 使用pd.cut将连续数值转换为离散区间
data['Bucketized_Column'] = pd.cut(data[column_to_bucket], bucket_boundaries, labels=False)
# 如果需要标签名,可以传递labels=True并自定义标签
# labels = ['Category_{}'.format(i) for i in range(1, num_buckets+1)]
# 打印转换后的数据查看结果
print(data.head())
#
相关问题
``` import pandas as pd import numpy as np data = pd.read_csv('TCGA_InfoWithGrade.csv')```将读取的数据第三列由连续值改为离散值,并将改后的数据打印出来,给出完整代码
为了将CSV文件`TCGA_InfoWithGrade.csv`的第三列(假设列为数值型)转换为离散值(例如,等宽区间划分),你可以使用pandas的`cut()`函数。这是一个示例代码:
```python
import pandas as pd
import numpy as np
# 读取数据
data = pd.read_csv('TCGA_InfoWithGrade.csv')
# 假设第三列名为'Column3',你可以自定义列名
column_to_cut = 'Column3'
# 定义离散分段的数量或间距(这里以5个等宽区间为例)
bins = np.arange(data[column_to_cut].min(), data[column_to_cut].max() + 0.5, 5)
# 将连续值分割为离散区间
data['DiscreteColumn3'] = pd.cut(data[column_to_cut], bins=bins, labels=False)
# 打印处理后的数据
print(data[['DiscreteColumn3']])
优化这段代码import os dir_path = "C:/Users/1028/Desktop/r" dir_py = os.listdir(dir_path) cancer='HNSC'#设置变量 train=pd.read_csv(dir_py+"\\tcga_data\\"+cancer+"\\ml_input.csv") target=pd.read_csv(dir_py+"\\tcga_data\\"+cancer+"\\tab_label.csv",index_col=0).values.ravel()#index_col=0表示将第一列作为索引列 indices = train.columns[2:]#提取索引,从第三列开始(索引2) train=train.iloc[:,2:].T.values#选择所有行和从第三列开始的所有列。然后通过.T进行转置操作,将数据框转换为NumPy数组
你可以稍微优化一下代码,将文件路径的拼接部分提取出来,避免重复写入。另外,还可以使用`numpy`库的`genfromtxt`函数来读取CSV文件,以简化读取和转置操作。以下是优化后的代码:
```python
import os
import pandas as pd
import numpy as np
dir_path = "C:/Users/1028/Desktop/r"
cancer = 'HNSC'
data_dir = os.path.join(dir_path, "tcga_data", cancer)
train_path = os.path.join(data_dir, "ml_input.csv")
label_path = os.path.join(data_dir, "tab_label.csv")
train = np.genfromtxt(train_path, delimiter=',', skip_header=1)
target = pd.read_csv(label_path, index_col=0).values.ravel()
indices = train[:, 2:].T
train = train[:, 2:].T
```
在这个例子中,我们使用`os.path.join`函数来拼接文件路径,然后使用`np.genfromtxt`函数来读取CSV文件并跳过标题行。最后,我们使用`.T`转置操作来得到索引和训练数据。请确保文件路径正确,并且你已经安装了所需的库(如pandas和numpy)。
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