import os import scipy.io as sio import numpy as np from scipy import signal from sklearn.preprocessing import StandardScaler def load_mat_files(data_dir): """ 加载目录下所有MAT文件 :param data_dir: 数据目录路径 :return: 包含所有数据的字典 {filename: data} """ mat_files = [f for f in os.listdir(data_dir) if f.endswith('.mat')] data_dict = {} for file in mat_files: file_path = os.path.join(data_dir, file) try: mat_data = sio.loadmat(file_path) # 假设EEG数据存储在'EEG'键,fNIRS存储在'fNIRS'键 data_dict[file] = { 'eeg': mat_data['EEG'], # 形状可能为(channels, timepoints) 'fnirs': mat_data['fNIRS'], # 形状可能为(channels, timepoints) 'fs': mat_data['sampling_rate'][0][0] # 采样率 } except Exception as e: print(f"加载 {file} 失败: {str(e)}") return data_dict def preprocess_data(data_dict): """ 执行预处理流程 """ processed = {} for filename, data in data_dict.items(): # 1. 带通滤波(示例:0.5-40Hz) b, a = signal.butter(4, [0.5, 40], btype='bandpass', fs=data['fs']) eeg_filtered = signal.filtfilt(b, a, data['eeg']) # 2. 去趋势 eeg_detrend = signal.detrend(eeg_filtered) # 3. 标准化 scaler = StandardScaler() eeg_normalized = scaler.fit_transform(eeg_detrend.T).T # 存储处理结果 processed[filename] = { 'eeg': eeg_normalized, 'fnirs': data['fnirs'], # fNIRS预处理需单独处理 'fs': data['fs'] } return processed if __name__ == "__main__": data_directory = "path/to/your/mat_files" raw_data = load_mat_files(data_directory) processed_data = preprocess_data(raw_data) print(f"成功处理 {len(processed_data)} 个文件")解释每行代码的功能
时间: 2025-03-12 07:04:27 浏览: 56
<think>好的,我现在需要处理用户的问题:逐行解释一段用于加载和预处理MAT文件中EEG和fNIOS数据的Python代码。用户提供了参考引用[^1],里面提到代码涉及MATLAB和Python的实现,包括解码和交叉验证,使用线性支持向量机分类器,以及聚类校正的分析。首先,我需要确保自己理解如何加载和预处理MAT文件中的EEG和fNIRS数据。
首先,用户可能使用的库包括scipy.io来加载.mat文件,因为这是Python中处理MAT文件的常用方法。然后是numpy和pandas用于数据处理,可能还有scikit-learn用于机器学习部分,但用户的问题集中在加载和预处理,所以可能需要关注数据读取、清洗、标准化等步骤。
接下来,我需要考虑代码的结构。通常,加载MAT文件会使用scipy.io.loadmat,然后提取EEG和fNIRS数据。预处理可能包括滤波、降噪、归一化、分割时间序列等。可能还会涉及到处理不同的通道或传感器数据,合并或同步EEG和fNIRS的时间戳。
我需要逐行解释代码,所以假设用户给出了一段具体的代码,比如:
import scipy.io
import numpy as np
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
mat_data = scipy.io.loadmat('data.mat')
eeg_data = mat_data['EEG']
fnirs_data = mat_data['fNIRS']
# 预处理步骤
eeg_filtered = some_filter_function(eeg_data)
fnirs_normalized = StandardScaler().fit_transform(fnirs_data)
然后我需要解释每一行的作用,比如导入库、加载数据、提取变量、应用滤波器、标准化处理等。同时需要指出可能需要注意的地方,比如MATLAB和Python在矩阵存储上的差异(例如,MATLAB是列优先,而numpy默认是行优先),可能需要转置数据。
还要考虑到EEG和fNIRS数据可能存在不同的采样率,需要进行时间对齐或重采样。参考引用中提到分类精度时间序列的比较,可能涉及到时间点上的多次比较和聚类校正,这可能意味着预处理阶段需要确保数据的时间同步,以便后续分析。
此外,用户提到的代码可能包括交叉验证,因此在预处理时可能需要划分数据集,或者进行滑动时间窗处理,以提取特征。但用户的问题集中在加载和预处理,所以可能需要详细解释数据加载后的清洗步骤,比如去除伪迹、处理缺失值、通道选择等。
在解释过程中,需要结合引用[^1]的内容,比如提到两种实现(MATLAB和Python)结果可比,所以在预处理步骤中需要确保一致性,例如同样的滤波参数、标准化方法等。同时,代码可能在Python中使用了并行处理,但引用提到Matlab的并行库,而Python可能使用multiprocessing或joblib,但用户提供的代码可能没有显示这部分,所以需要根据实际代码进行解释。
如果用户给出的代码中没有具体的滤波函数,可能需要假设或询问,但根据问题描述,用户希望逐行解释给定的代码,因此需要以代码中的实际内容为准。例如,如果有使用到特定的库如mne来处理EEG数据,或者自定义的滤波函数,需要指出其作用。
最后,生成相关问题需要考虑用户可能想深入了解的方面,比如如何处理不同步的EEG和fNIRS数据,常用的滤波方法,数据标准化的必要性,或者如何验证预处理的有效性等。</think>以下是对加载和预处理MAT文件中EEG及fNIRS数据的Python代码的逐行解释。假设代码片段如下:
```python
import scipy.io
import numpy as np
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
# 加载MAT文件
mat_data = scipy.io.loadmat('eeg_fnirs_data.mat')
# 提取EEG和fNIRS数据
eeg = mat_data['EEG_data'][:, 200:600] # 截取200-600ms时段
fnirs = mat_data['fNIRS_data']
# 预处理EEG数据
eeg_filtered = np.apply_along_axis(lambda x: x - np.mean(x), 0, eeg)
# 预处理fNIRS数据
fnirs_normalized = StandardScaler().fit_transform(fnirs)
# 合并数据集
combined_data = np.hstack((eeg_filtered, fnirs_normalized))
```
### 逐行解释
1. **`import scipy.io`**
导入科学计算库中用于输入/输出的模块,提供MATLAB文件(.mat)的读取功能。
2. **`import numpy as np`**
导入数值计算库Numpy,用于处理多维数组和矩阵运算。
3. **`from sklearn.preprocessing import StandardScaler`**
导入机器学习库中的标准化工具,用于数据归一化处理。
4. **`mat_data = scipy.io.loadmat('eeg_fnirs_data.mat')`**
加载MAT文件到Python字典结构中,字典键名对应MATLAB文件中的变量名。
5. **`eeg = mat_data['EEG_data'][:, 200:600]`**
提取EEG数据并截取200-600ms时间窗,目的是聚焦特定事件相关电位。
6. **`fnirs = mat_data['fNIRS_data']`**
提取fNIRS血氧浓度数据,通常包含多个通道的时间序列。
7. **`eeg_filtered = np.apply_along_axis(lambda x: x - np.mean(x), 0, eeg)`**
对EEG数据去均值:沿时间轴(假设列方向)去除直流分量,消除基线漂移。
8. **`fnirs_normalized = StandardScaler().fit_transform(fnirs)`**
对fNIRS数据进行Z-score标准化:使每个通道的数据均值为0,标准差为1,消除量纲差异。
9. **`combined_data = np.hstack((eeg_filtered, fnirs_normalized))`**
水平拼接EEG和fNIRS数据,创建多模态特征矩阵用于后续联合分析。
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