用R语言同时对一组数据70例样本的1024个变量进行正态性检验和方差齐性检验,检验时不包括ID和group,group为0和1,同时符合条件的做t检验,有任何一者不符合条件者做非参数检验,且分别输出t检验统计分析结果P<0.05的变量和非参数检验结果P<0.05的变量,如何做
时间: 2025-01-20 09:14:27 浏览: 57
在R语言中,你可以通过以下步骤来进行这组数据分析:
1. **加载必要的库**:
首先安装并加载一些必要的包,例如`tidyverse`(用于数据操作)、`DescTools`(用于描述性统计和p值计算)以及`WRS2`(用于非参数检验)。
```R
install.packages("tidyverse")
install.packages("DescTools")
install.packages("WRS2")
library(tidyverse)
library(DescTools)
library(WRS2)
```
2. **读取和预处理数据**:
从文件读取数据,并剔除ID和group列。假设数据存储在CSV文件中,可以使用`read.csv`或`read_table`。
```R
data <- read.csv("your_data_file.csv") %>%
select(-c(ID, group)) # 去除非目标列
```
3. **正态性检验**:
对每个连续变量(数值型变量)使用Shapiro-Wilk或Anderson-Darling测试判断其是否服从正态分布。可以使用`shapiro.test`和`andersonDarlingTest`函数。
```R
normality_test <- data %>%
select_if(is.numeric) %>%
map_dfr(~ shapiro.test(.x) %>% bind_rows(andersonDarlingTest(.x)))
normality_test$variable <- rownames(normality_test)
# 检查哪些变量显著非正态
non_normal <- normality_test[abs(normality_test$p.value) < 0.05, ]
```
4. **方差齐性检验**:
使用Levene's test(对于等方差检验)或Bartlett's test(适用于异方差)检查各个组间的方差是否相等。
```R
variance_test <- tapply(data[, -1], data$group, function(x) leveneTest(x ~ 1)) # 或者 bartlett.test
# 获取P值小于0.05的变量
unequal_variances <- unlist(variance_test$p.value) < 0.05
unequal_variances_variables <- names(which(unequal_variances))
```
5. **根据检验结果进行t检验或非参数检验**:
对于正态且方差齐的变量,用`t.test`;其他变量则用wilcox.test(非参数检验)。
```R
ttest_results <- data %>%
filter(!unequal_variances_variables %in% names(.), !rownames(normality_test) %in% .names(normality_test)) %>%
group_by(group) %>%
summarise_all(t.test, list(mean = "mean", sd = "sd"))
# 对于非参数检验
non_parametric_results <- data %>%
filter(unequal_variances_variables %in% names(.) | rownames(normality_test) %in% .names(normality_test)) %>%
group_by(group) %>%
mutate(across(where(is.numeric), wilcox.test, p.value = "conf.int")) %>%
unnest(p.value, conf.int)
```
最后,将结果整理成合适的格式并保存输出。注意,上述代码假设了所有连续变量都是数值类型的。如有分类变量,可能需要先进行转换或合并到group变量一起处理。
阅读全文
相关推荐


















