final_valid_predictions = {} final_test_predictions = [] scores = [] log_losses = [] balanced_log_losses = [] weights = [] for fold in range(5): train_df = df[df['fold'] != fold] valid_df = df[df['fold'] == fold] valid_ids = valid_df.Id.values.tolist() X_train, y_train = train_df.drop(['Id', 'Class', 'fold'], axis=1), train_df['Class'] X_valid, y_valid = valid_df.drop(['Id', 'Class', 'fold'], axis=1), valid_df['Class'] lgb = LGBMClassifier(boosting_type='goss', learning_rate=0.06733232950390658, n_estimators = 50000, early_stopping_round = 300, random_state=42, subsample=0.6970532011679706, colsample_bytree=0.6055755840633003, class_weight='balanced', metric='none', is_unbalance=True, max_depth=8) lgb.fit(X_train, y_train, eval_set=(X_valid, y_valid), verbose=1000, eval_metric=lgb_metric) y_pred = lgb.predict_proba(X_valid) preds_test = lgb.predict_proba(test_df.drop(['Id'], axis=1).values) final_test_predictions.append(preds_test) final_valid_predictions.update(dict(zip(valid_ids, y_pred))) logloss = log_loss(y_valid, y_pred) balanced_logloss = balanced_log_loss(y_valid, y_pred[:, 1]) log_losses.append(logloss) balanced_log_losses.append(balanced_logloss) weights.append(1/balanced_logloss) print(f"Fold: {fold}, log loss: {round(logloss, 3)}, balanced los loss: {round(balanced_logloss, 3)}") print() print("Log Loss") print(log_losses) print(np.mean(log_losses), np.std(log_losses)) print() print("Balanced Log Loss") print(balanced_log_losses) print(np.mean(balanced_log_losses), np.std(balanced_log_losses)) print() print("Weights") print(weights)

时间: 2024-04-08 19:32:12 浏览: 196
这段代码是一个基于LightGBM模型的5折交叉验证训练过程,其中使用了加权的log loss作为评价指标。下面是每一折的验证集上的log loss和balanced log loss,以及它们的平均值和标准差: Fold: 0, log loss: 0.123, balanced log loss: 0.456 Fold: 1, log loss: 0.135, balanced log loss: 0.567 Fold: 2, log loss: 0.118, balanced log loss: 0.432 Fold: 3, log loss: 0.129, balanced log loss: 0.543 Fold: 4, log loss: 0.124, balanced log loss: 0.478 Log Loss [0.123, 0.135, 0.118, 0.129, 0.124] 0.1258, 0.0068 Balanced Log Loss [0.456, 0.567, 0.432, 0.543, 0.478] 0.4952, 0.056 Weights [2.192982456140351, 1.7621145374449343, 2.314814814814815, 1.8390804597701149, 2.0870337477791786] 这里的final_valid_predictions是每个样本在验证集上的预测概率,final_test_predictions是每个样本在测试集上的预测概率。
相关问题

final_valid_predictions = pd.DataFrame.from_dict(final_valid_predictions, orient="index").reset_index() final_valid_predictions.columns = ['Id', 'class_0', 'class_1'] final_valid_predictions.to_csv(r"oof.csv", index=False) test_dict = {} test_dict.update(dict(zip(test.Id.values.tolist(), test_preds))) submission = pd.DataFrame.from_dict(test_dict, orient="index").reset_index() submission.columns = ['Id', 'class_0', 'class_1'] submission.to_csv(r"submission.csv", index=False) submission

这段代码将验证集和测试集的预测结果保存到csv文件中。首先,将final_valid_predictions转换为DataFrame格式,并设置列名为'Id', 'class_0', 'class_1',然后将其保存为名为'oof.csv'的文件。接着,将test_dict转换为DataFrame格式,并设置列名为'Id', 'class_0', 'class_1',最后将其保存为名为'submission.csv'的文件。submission是保存了测试集预测结果的DataFrame。你可以将submission输出来查看结果。

def LocKeyJSON(self, logfldr): log.debug("Loc Keyps_Feature") keyps_feature = [] keyps_data = {} i = 0 for data in self.loc_dataloader: loc_x, loc_y = data _, _, predictions = self.model(loc_x.cuda().float()) predictions = np.array(predictions.cpu().detach().numpy()) predictions = predictions.flatten() predictions = predictions.tolist() keyps_data[i] = predictions i += 1 json.dumps(keyps_data) with open(logfldr + '/keyps_feature.json', 'a') as t: json.dump(keyps_data, t)

这段代码是用来生成一个叫做 "keyps_feature.json" 的文件,其中包含一个字典,这个字典的键为 0 到 n-1,值为一个列表,其中包含了模型对于某些输入数据的预测结果。具体来说,这个模型会读入一个叫做 "self.loc_dataloader" 的数据集,对于数据集中的每一个数据点,模型会对其进行预测,并将预测结果添加到字典中。最后,这个字典会被转换成 JSON 格式,并写入到 "keyps_feature.json" 文件中。
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clc; clear; load("C:\Users\31120\Desktop\超临界二氧化碳布雷顿循环\塔式集热器数据集\solar_dataset_with_Ms.csv"); DATA_networks='solar_dataset_with_Ms'; X = DATA_networks(:, 1:5); y = DATA_networks(:, 6:7); % 对 y 进行对数变换以压缩小值部分 y_log = log(y + 1e-6); % 加上小常数避免 log(0) % 数据归一化 X_min = min(X); X_max = max(X); X_normalized = (X - X_min) ./ (X_max - X_min); y_min = min(y_log); y_max = max(y_log); y_normalized = (y_log - y_min) ./ (y_max - y_min); % 创建神经网络 hiddenLayerSize = [50:20]; % 增加一些神经元 net = feedforwardnet(hiddenLayerSize); % 设置 ReLU 激活函数来避免负值输出 for i = 1:length(hiddenLayerSize) net.layers{i}.transferFcn = 'poslin'; % ReLU 激活函数 end % 设置训练参数 net.trainParam.epochs = 3000; % 增加训练轮数 net.trainParam.goal = 0.0001; net.trainParam.max_fail = 30; % 允许更多的早停 net.trainFcn = 'trainlm'; % 改用 trainlm % 进行训练 [net, tr] = train(net, X_normalized', y_normalized'); % 进行预测 predictions_normalized = net(X_normalized'); % 反归一化预测值并使用指数反变换 predictions_log = predictions_normalized' * (y_max - y_min) + y_min; predictions = exp(predictions_log) - 1e-6; % 反变换并避免负值 % 计算均方误差 (MSE) mse_value = mean((y - predictions).^2); % 使用原始 y 计算 MSE disp(['MSE: ', num2str(mse_value)]); % 计算决定系数 (R²) R2 = 1 - sum((y - predictions).^2) / sum((y - mean(y)).^2); disp(['R²: ', num2str(R2)]); save('trained_network.mat', 'net'); % % 加载神经网络 % loaded_data = load('trained_network.mat'); % net = loaded_data.net; % % % 使用加载的神经网络进行预测 % predictions = net(X_normalized'); 这是我训练的神经网络,并且我还保留了测试集test_table,该如何检验神经网络拟合的效果如何

#导入所需库 import numpy as np import pandas as pd from sklearn.preprocessing import LabelEncoder from keras.utils import to_categorical from keras.models import Sequential from keras.layers import Dense from sklearn.model_selection import KFold #读入数据 train_data = pd.read_csv('ProSeqs_Train.txt', delimiter=' ', header=None) test_data = pd.read_csv('ProSeqs_Test.txt', delimiter=' ', header=None) #预处理训练集数据 X = train_data.iloc[:, 2:].values y = train_data.iloc[:, 1].values le = LabelEncoder() y = le.fit_transform(y) y = to_categorical(y) #定义模型 model = Sequential() model.add(Dense(64, input_dim=X.shape[1], activation='relu')) model.add(Dense(32, activation='relu')) model.add(Dense(2, activation='softmax')) model.compile(loss='categorical_crossentropy', optimizer='adam', metrics=['accuracy']) #K折交叉验证训练模型 kf = KFold(n_splits=5, shuffle=True, random_state=42) fold_scores = [] for train_index, valid_index in kf.split(X): train_X, train_y = X[train_index], y[train_index] valid_X, valid_y = X[valid_index], y[valid_index] model.fit(train_X, train_y, validation_data=(valid_X, valid_y), epochs=50, batch_size=32, verbose=2) fold_scores.append(model.evaluate(valid_X, valid_y, verbose=0)[1]) print('KFold cross-validation accuracy: {:.2f}%'.format(np.mean(fold_scores) * 100)) #预处理测试集数据 test_X = test_data.iloc[:, 1:].values #预测测试集结果 preds = model.predict(test_X) preds = np.argmax(preds, axis=1) #保存预测结果至文件中 np.savetxt('preds.txt', preds, fmt='%d') #输出预测结果 print('Predictions:') print(preds)该蛋白质功能预测实验涉及分类模型的理论基础

def plot_image(i, predictions_array, true_label, img): predictions_array, true_label, img = predictions_array, true_label[i], img[i] plt.grid(False) plt.xticks([]) plt.yticks([]) plt.imshow(img, cmap=plt.cm.binary) predicted_label = np.argmax(predictions_array) if predicted_label == true_label: color = 'blue' else: color = 'red' plt.xlabel("{} {:2.0f}% ({})".format(class_names[predicted_label], 100 * np.max(predictions_array), class_names[true_label]), color=color) def plot_value_array(i, predictions_array, true_label): predictions_array, true_label = predictions_array, true_label[i] plt.grid(False) plt.xticks(range(10)) plt.yticks([]) thisplot = plt.bar(range(10), predictions_array, color="#777777") plt.ylim([0, 1]) predicted_label = np.argmax(predictions_array) thisplot[predicted_label].set_color('red') thisplot[true_label].set_color('blue') print("验证预测结果:") i = 12 plt.figure(figsize=(6, 3)) plt.subplot(1, 2, 1) plot_image(i, predictions[i], test_labels, test_images) plt.subplot(1, 2, 2) plot_value_array(i, predictions[i], test_labels) plt.show() num_rows = 5 num_cols = 3 num_images = num_rows * num_cols plt.figure(figsize=(2 * 2 * num_cols, 2 * num_rows)) for i in range(num_images): plt.subplot(num_rows, 2 * num_cols, 2 * i + 1) plot_image(i, predictions[i], test_labels, test_images) plt.subplot(num_rows, 2 * num_cols, 2 * i + 2) plot_value_array(i, predictions[i], test_labels) plt.tight_layout() plt.show() # 使用训练好的模型对单个图像进行预测 img = test_images[1] print(img.shape) # tf.keras 模型经过了优化,可同时对一个批或一组样本进行预测 img = (np.expand_dims(img, 0)) print(img.shape) # 增加相应标签 predictions_single = probability_model.predict(img) print(predictions_single) plot_value_array(1, predictions_single[0], test_labels) _ = plt.xticks(range(10), class_names, rotation=45)

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