网络药理学数据库
时间: 2025-07-04 14:52:53 浏览: 7
### 网络药理学相关数据库
在网络药理学的研究中,多个数据库提供了丰富的资源来支持中药成分、靶点及其相互作用的分析。以下是几个常用的数据库及相关功能:
#### 1. **TCMSP (Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform)**
TCMSP 是一个专注于中医药系统的药理学数据库平台,能够通过直接搜索中药名称获取其对应的化学成分、口服生物利用度(OB)和类药性(DL)。此外,还可以进一步查询这些成分所关联的靶点信息[^1]。然而,该数据库存在一定的局限性,例如部分中药材未被完全收录,某些药材中的成分也不够全面。
#### 2. **ETCM (Encyclopedia of Traditional Chinese Medicine)**
ETCM 提供了一个综合性的知识库,允许用户探索中药草药、配方、化学成分、基因靶标以及它们与疾病或信号通路的关系。它不仅有助于构建简单的“中药-成分-靶点”网络图,还能够帮助研究人员深入理解复杂的生物学机制。
#### 3. **BATMAN-TCM (Bioinformatics Analysis Tool for Molecular mechANism of TCM)**
BATMAN-TCM 是一种集成化的分析工具,专为揭示传统中医的作用机理而设计。尽管具体的使用方法需要自行摸索,但它无疑是一个强大的辅助手段,在处理大规模数据时尤为有用。
#### 4. **DAVID (Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery)**
除了上述针对中药的具体数据库之外,像 DAVID 这样的通用型功能性注释工具也非常重要。它可以用来执行 GO 功能分类和 KEGG 代谢通路富集分析,从而更好地解释由实验或者计算预测得到的一系列目标基因如何参与到细胞过程之中[^3]。
#### 5. **其他可能有用的资源**
对于更广泛的分子对接需求来说,一些额外的服务也可能派上用场——比如 TCMSP 不仅限于理论上的数据分析,甚至还能提供化合物结构文件转换成适合虚拟筛选格式的支持[^4]。
综上所述,以上提到的各种在线资料共同构成了开展现代科学研究所需的基础框架条件。
```python
import requests
from bs4 import BeautifulSoup
def fetch_database_info(url):
response = requests.get(url)
soup = BeautifulSoup(response.text, 'html.parser')
title = soup.title.string.strip()
return f"Fetched database name is {title}"
print(fetch_database_info("https://old.tcmsp-e.com/tcmsp.php"))
```
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