from sklearn.feature_selection import SelectFromModel from sklearn.ensemble import RandomForestClassifier as RFC RFC_=RFC(n_estimators=10,random_state=0) X_embedded=SelectFromModel(RFC_,threshold=0.005).fit_transform(x,y)
时间: 2024-04-21 07:22:24 浏览: 150
这段代码使用了特征选择方法 `SelectFromModel`,并结合随机森林分类器 `RFC` 进行特征选择。首先,通过 `RFC(n_estimators=10, random_state=0)` 创建了一个随机森林分类器对象 `RFC_`,其中 `n_estimators` 参数指定了随机森林中决策树的数量,`random_state` 参数用于控制随机性。
然后,使用 `SelectFromModel(RFC_, threshold=0.005)` 创建了一个特征选择器对象 `X_embedded`。这里的 `threshold` 参数指定了特征选择的阈值。特征选择器将基于随机森林分类器的重要性评估结果,选择重要性大于阈值的特征,并将原始数据 `x` 转换为新的特征矩阵。
这段代码的作用是进行特征选择,选取重要性大于阈值的特征,从而提高模型的性能或减少计算开销。如果你有关于特征选择或随机森林的进一步问题,欢迎继续提问!
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from sklearn.datasets import load_breast_cancer from sklearn.model_selection import train_test_split from sklearn.ensemble import RandomForestClassifier from sklearn.metrics import accuracy_score from lime.lime_tabular import LimeTabularExplainer import numpy as np import pandas as pd # 准备数据 data = load_breast_cancer() # df=pd.DataFrame(data.data,columns=data.feature_names) # df['target']=data.target # print(df.head()) X = data.data y = data.target # 划分训练集和测试集 X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, y, test_size=0.3, random_state=42) # 训练模型 rfc = RandomForestClassifier(n_estimators=100, random_state=42) rfc.fit(X_train, y_train) # 预测结果 y_pred = rfc.predict(X_test) accuracy = accuracy_score(y_test, y_pred) print(f"Accuracy:{accuracy:.3f}") # 解释模型结果 def explain_sample(x, model, feature_names): explainer = LimeTabularExplainer(X_train, feature_names=feature_names, class_names=data.target_names) exp = explainer.explain_instance(x, model.predict_proba, num_features=len(feature_names)) return exp # 随机选择一个测试样本并解释 idx = np.random.randint(len(X_test)) x=X_test[idx] exp=explain_sample(x,rfc,data.feature_names) fig=exp.as_pyplot_figure() print(f"Sample index:{idx}") fig.show()优化一下这段代码,让可视化图片不要一闪而过
可以使用`input()`函数让程序等待用户输入后再继续执行,这样就可以让可视化图片在用户输入后再显示。代码如下:
```python
from sklearn.datasets import load_breast_cancer
from sklearn.model_selection import train_test_split
from sklearn.ensemble import RandomForestClassifier
from sklearn.metrics import accuracy_score
from lime.lime_tabular import LimeTabularExplainer
import numpy as np
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
# 准备数据
data = load_breast_cancer()
X = data.data
y = data.target
# 划分训练集和测试集
X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, y, test_size=0.3, random_state=42)
# 训练模型
rfc = RandomForestClassifier(n_estimators=100, random_state=42)
rfc.fit(X_train, y_train)
# 预测结果
y_pred = rfc.predict(X_test)
accuracy = accuracy_score(y_test, y_pred)
print(f"Accuracy:{accuracy:.3f}")
# 解释模型结果
def explain_sample(x, model, feature_names):
explainer = LimeTabularExplainer(X_train, feature_names=feature_names, class_names=data.target_names)
exp = explainer.explain_instance(x, model.predict_proba, num_features=len(feature_names))
return exp
# 随机选择一个测试样本并解释
idx = np.random.randint(len(X_test))
x=X_test[idx]
exp=explain_sample(x,rfc,data.feature_names)
fig=exp.as_pyplot_figure()
print(f"Sample index:{idx}")
fig.show()
input("Press Enter to continue...")
```
这样,当程序运行到`fig.show()`时,会显示可视化图片,并等待用户输入后才会继续执行下去。用户可以在图片显示的状态下仔细观察,直到输入回车键后程序才会结束。
import numpy as np import xlrd import matplotlib.pyplot as plt from sklearn.feature_selection import RFE from sklearn.ensemble import RandomForestClassifier from sklearn.svm import SVC from sklearn.linear_model import LogisticRegression from sklearn.model_selection import cross_val_score def excel2m(path):#读excel数据转为矩阵函数 data = xlrd.open_workbook(path) table = data.sheets()[0] # 获取excel中第一个sheet表 nrows = table.nrows # 行数 ncols = table.ncols # 列数 datamatrix = np.zeros((nrows, ncols)) for x in range(ncols): cols = table.col_values(x) cols1 = np.matrix(cols) # 把list转换为矩阵进行矩阵操作 datamatrix[:, x] = cols1 # 把数据进行存储 return datamatrix x=excel2m("factors.xlsx") x=np.matrix(x) y=excel2m("RON.xlsx") y=np.matrix(y) rfc=RandomForestClassifier(n_estimators=10,random_state=0) score=[] for i in range(1,200,10): rfe = RFE(estimator=rfc, n_features_to_select=i, step=10).fit(x, y.astype('int')) rfe.support_.sum() rfe.ranking_ x_wrapper=rfe.transform(x) once=cross_val_score(rfc,x_wrapper,y.astype('int'),cv=5).mean() score.append(once) plt.figure(figsize=[20,5]) plt.plot(range(1,200,10),score) plt.xticks(range(1,200,10)) plt.show() np.savetxt('score.csv', score, delimiter = ',') # 确定选择特征数量后,看各个特征得分排名 # 每个特征的得分排名,特征得分越低(1最好),表示特征越好 #print(rfe.ranking_) #np.savetxt('ranking.csv', rfe.ranking_, delimiter = ',') # 每次交叉迭代各个特征得分 #print(rfe.grid_scores_) #np.savetxt('grid_scores.csv', rfe.grid_scores_, delimiter = ',')
这段代码主要实现的功能是特征筛选,其中使用了随机森林分类器(RandomForestClassifier)和递归特征消除算法(RFE),以提高模型的准确性和降低过拟合的风险。
具体流程为:首先将读取的excel数据转换为矩阵形式,然后通过循环调整特征数量,利用RFE算法进行特征筛选,得到一个新的特征子集。接着,利用交叉验证计算新特征子集下的模型得分,并将得分保存在score列表中。最后,通过matplotlib库将score列表中的得分绘制成图表,以便直观地查看得分随特征数量的变化情况。
需要注意的是,代码中还将特征得分排名和每次交叉迭代各个特征得分保存到了csv文件中,并注释了相关代码。
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