我使用的是linux Ubuntuubuntu@ubuntu-virtual-machine:~/桌面/gromacs-2018.8/build$ sudo cmake .. -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/home/ubuntu/gmx2018.8 -DGMX_SIMD=AVX2_256 -DGMX_BUILD_OWN_FFTW=OFF CMake Warning (dev) at /usr/share/cmake-3.22/Modules/FindPackageHandleStandardArgs.cmake:438 (message): The package name passed to `find_package_handle_standard_args` (pygments) does not match the name of the calling package (Sphinx). This can lead to problems in calling code that expects `find_package` result variables (e.g., `_FOUND`) to follow a certain pattern. Call Stack (most recent call first): cmake/FindPythonModule.cmake:76 (find_package_handle_standard_args) cmake/FindSphinx.cmake:61 (find_python_module) docs/CMakeLists.txt:68 (find_package) This warning is for project developers. Use -Wno-dev to suppress it. -- Configuring done -- Generating done -- Build files have been written to: /home/ubuntu/桌面/gromacs-2018.8/build ubuntu@ubuntu-virtual-machine:~/桌面/gromacs-2018.8/build$ sudo make install Consolidate compiler generated dependencies of target tng_io_zlib [ 0%] Built target tng_io_zlib Consolidate compiler generated dependencies of target tng_io_obj [ 2%] Built target tng_io_obj Consolidate compiler generated dependencies of target libgromacs [ 2%] Building CXX object src/gromacs/CMakeFiles/libgromacs.dir/mdlib/minimize.cpp.o /home/ubuntu/桌面/gromacs-2018.8/src/gromacs/mdlib/minimize.cpp: In function ‘double gmx::do_steep(FILE*, t_commrec*, const gmx::MDLogger&, int, const t_filenm*, const gmx_output_env_t*, const MdrunOptions&, gmx_vsite_t*, gmx_constr_t, gmx::IMDOutputProvider*, t_inputrec*, gmx_mtop_t*, t_fcdata*, t_state*, ObservablesHistory*, gmx::MDAtoms*, t_nrnb*, gmx_wallcycle_t, t_forcerec*, const ReplicaExchangeParameters&, gmx_membed_t*, gmx_walltime_accounting_t)’: /home/ubuntu/桌面/gromacs-2018.8/src/gromacs/mdlib/minimize.cpp:2542:32: error: ‘numeric_limits’ is not a member of ‘std’ 2542 | s_try->epot = std::numeric_limits<real>::infi

<think>好的，用户遇到了在Ubuntu Linux上编译GROMACS 2018.8时出现的错误'numeric_limits is not a member of std'。我需要分析可能的原因，并提供解决方案。首先，这个错误通常与C++标准库的头文件有关，尤其是`<limits>`头文件是否被正确包含。 根据引用[1]中的信息，用户可能缺少必要的编译器或依赖库，比如g++。如果编译器版本过低，可能不支持C++11或更高标准，而GROMACS可能需要这些标准。需要检查是否安装了正确版本的g++，并且是否在编译时启用了C++11支持。 另外，引用[3]提到AMD CPU需要设置-DGMX_SIMD=SSE4.1，但用户的问题可能与此无关。不过，这提示编译时的参数设置可能影响整体编译过程，需要确认CMake参数是否正确，尤其是与编译器相关的选项。 可能的解决方案包括： 1. 在源代码中添加`#include <limits>`到出现错误的文件中，但这可能需要用户定位具体文件，不太方便。 2. 检查CMake配置，确保启用了C++11或更高标准。GROMACS可能需要特定的C++标准，而旧版编译器默认可能不启用。可以在CMake命令中添加`-DCMAKE_CXX_FLAGS="-std=c++11"`。 3. 更新编译器版本，确保支持所需的C++标准。如果系统自带的g++版本过低，可能需要安装较新版本，如g++-7或更高。 引用[2]中的用户使用了特定的CMake参数，如指定mpicc和mpicxx，可能涉及编译器兼容性问题。用户需要确认使用的C++编译器是否与GROMACS 2018.8兼容，并且正确设置了环境变量。 此外，检查GROMACS的官方文档或社区讨论是否有类似问题的解决方案。可能其他用户遇到相同问题，并提供了补丁或配置调整方法。 总结步骤： 1. 确认g++版本，升级到支持C++11的版本。 2. 在CMake命令中添加C++11标准标志。 3. 确保所有依赖库（如fftw3）正确安装，路径设置正确。 4. 清理构建目录，重新运行CMake和编译。 需要指导用户逐步检查这些方面，并提供具体的命令行操作示例，如安装新编译器、修改CMake参数等。同时，提醒用户注意环境变量和路径配置，如引用[1]中提到的修改.bashrc文件。</think>### 分步解决方案：解决GROMACS 2018.8编译错误'numeric_limits is not a member of std' #### **1. 检查C++编译器版本** 该错误通常因未包含`<limits>`头文件或编译器未启用C++11标准导致。GROMACS 2018.8需支持C++11的编译器： ```bash g++ --version # 确认版本≥4.8.1（最低支持C++11的版本） ``` 若版本过低，需升级： ```bash sudo apt install g++-7 # 安装g++-7（Ubuntu 20.04默认仓库提供） export CXX=/usr/bin/g++-7 # 临时指定编译器路径 ``` #### **2. 强制启用C++11标准** 在CMake配置中添加编译参数`-std=c++11`： ```bash cd gromacs-2018.8/build/ cmake3 .. -DCMAKE_CXX_FLAGS="-std=c++11" -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=... [其他参数] ``` 若使用其他编译器（如Intel或Clang），需同步调整`-DCMAKE_CXX_COMPILER`参数[^2]。 #### **3. 检查代码包含头文件** 定位报错文件（如`src/file.cpp`），手动添加： ```cpp #include <limits> // 添加至文件开头 ``` 但此方法需修改源码，建议优先通过编译器配置解决。 #### **4. 清理并重新编译** 确保构建目录干净： ```bash rm -rf * # 在build目录下执行 cmake3 .. [含修正后的参数] make install -j ``` #### **5. 验证依赖项** 确认FFTW3等依赖库路径正确： ```bash export CMAKE_PREFIX_PATH=/path/to/fftw3 # 引用[1]中的路径需与实际一致 ``` #### **6. 环境变量配置** 编译完成后，按引用[1]要求更新`.bashrc`： ```bash echo "source /安装目录/gmx2018.8/bin/GMXRC" >> ~/.bashrc source ~/.bashrc ``` --- ###