首页使用pyhon将nrrd的原图和标签的3D文件切片成2维图片，给出规范代码

使用pyhon将nrrd的原图和标签的3D文件切片成2维图片，给出规范代码

时间: 2023-11-27 09:52:15 浏览: 203

以下是使用Python将nrrd格式的原图和标签的3D文件切片成2D图片的规范代码： ```python import nrrd import os import numpy as np import cv2 # 读入nrrd格式的原图和标签文件 data, header = nrrd.read('original.nrrd') label, header = nrrd.read('label.nrrd') # 获取原图和标签的体素尺寸和切片数量 voxel_size = header['spacings'] num_slices = data.shape[2] # 创建保存切片的文件夹 if not os.path.exists('slices'): os.mkdir('slices') # 循环遍历每一张切片 for i in range(num_slices): # 提取原图和标签中的当前切片 current_data_slice = data[:, :, i] current_label_slice = label[:, :, i] # 将原图和标签转换为灰度图 current_data_slice = np.uint8(current_data_slice) current_label_slice = np.uint8(current_label_slice) # 将原图和标签缩放到0-255的范围内 current_data_slice = cv2.normalize(current_data_slice, None, 0, 255, cv2.NORM_MINMAX) current_label_slice = cv2.normalize(current_label_slice, None, 0, 255, cv2.NORM_MINMAX) # 保存原图和标签的当前切片 cv2.imwrite('slices/data_{}.png'.format(i), current_data_slice) cv2.imwrite('slices/label_{}.png'.format(i), current_label_slice) ``` 其中，`nrrd.read()`函数用于读入nrrd格式的文件，`os.mkdir()`函数用于创建保存切片的文件夹，`cv2.normalize()`函数用于将原图和标签缩放到0-255的范围内，`cv2.imwrite()`函数用于保存切片图片。

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