forest = RandomForestRegressor(n_estimators = 100,criterion = 'friedman_mse',random_state = 1,n_jobs = -1) forest.fit(x_train,y_train) forest_train_pred = forest.predict(x_train) forest_test_pred = forest.predict(x_test)
时间: 2024-01-27 16:02:54 浏览: 120
这段代码是使用随机森林回归模型进行训练和预测。首先,创建了一个随机森林回归模型,其中n_estimators参数设置为100,criterion参数设置为'friedman_mse',random_state参数设置为1,n_jobs参数设置为-1以利用所有可用的CPU核心。接下来,使用训练数据x_train和对应的目标值y_train来训练模型。然后,使用训练好的模型对训练数据x_train进行预测,将结果保存在forest_train_pred中。最后,使用训练好的模型对测试数据x_test进行预测,将结果保存在forest_test_pred中。
相关问题
优化代码KNeighborsClassifier(algorithm='auto', leaf_size=30, metric='minkowski', metric_params=None, n_jobs=1, n_neighbors=5, p=2, weights='uniform') GradientBoostingClassifier(criterion='friedman_mse', init=None, learning_rate=0.1, loss='deviance', max_depth=3, max_features=None, max_leaf_nodes=None, min_impurity_decrease=0.0, min_impurity_split=None, min_samples_leaf=1,min_samples_split=2, min_weight_fraction_leaf=0.0,n_estimators=100, presort='auto', random_state=None,subsample=1.0, verbose=0, warm_start=False),出错TypeError: __init__() got an unexpected keyword argument 'min_impurity_split'
这个错误是因为在 GradientBoostingClassifier 中的参数 min_impurity_split 已经被弃用,应该使用参数 min_impurity_decrease 来代替。你只需要将参数名 min_impurity_split 改为 min_impurity_decrease 即可解决该问题。
data = pd.read_excel(‘C:/lydata/Traintest1.xlsx’) X = data.drop(‘HER2_G’, axis=1) y = data[‘HER2_G’] kf = KFold(n_splits=5, shuffle=True, random_state=42) accuracy_scores = [] precision_scores = [] recall_scores = [] f1_scores = [] auc_scores = [] total_confusion_matrix = np.zeros((len(np.unique(y)), len(np.unique(y))), dtype=int) rf = RandomForestClassifier(random_state=42, n_estimators=49, max_depth=4, class_weight=‘balanced’) rfe = RFE(rf, n_features_to_select=10) pipeline = Pipeline([ (‘smote’, SMOTE(k_neighbors=1,sampling_strategy=0.8, random_state=42)), (‘tomek’, TomekLinks()), (‘scaler’, StandardScaler()), (‘rfe’, rfe), (‘gb’, GradientBoostingClassifier( loss=‘log_loss’, learning_rate=0.03, n_estimators=1300, subsample=0.9, criterion=‘friedman_mse’, min_samples_split=2, min_samples_leaf=2, min_weight_fraction_leaf=0.0, max_depth=4, min_impurity_decrease=0.0, init=None, random_state=42, max_features=None, verbose=0, max_leaf_nodes=None, warm_start=True, validation_fraction=0.1, n_iter_no_change=None, tol=0.0001, ccp_alpha=0.0 )) ]) for train_index, test_index in kf.split(X): X_train, X_test = X.iloc[train_index], X.iloc[test_index] y_train, y_test = y.iloc[train_index], y.iloc[test_index] pipeline.fit(X_train, y_train) y_pred = pipeline.predict(X_test) y_proba = pipeline.predict_proba(X_test)[:, 1] accuracy_scores.append(accuracy_score(y_test, y_pred)) precision_scores.append(precision_score(y_test, y_pred)) recall_scores.append(recall_score(y_test, y_pred)) f1_scores.append(f1_score(y_test, y_pred)) auc_scores.append(roc_auc_score(y_test, y_proba)) cm = confusion_matrix(y_test, y_pred) total_confusion_matrix += cm accuracy = np.mean(accuracy_scores) precision = np.mean(precision_scores) recall = np.mean(recall_scores) f1 = np.mean(f1_scores) auc = np.mean(auc_scores) print(“Gradient Boosting 参数:”) print(pipeline.named_steps[‘gb’].get_params()) print(f"Gradient Boosting 平均 accuracy: {accuracy:.2f}“) print(f"Gradient Boosting 平均 precision: {precision:.2f}”) print(f"Gradient Boosting 平均 recall: {recall:.2f}“) print(f"Gradient Boosting 平均 F1 score: {f1:.2f}”) print(f"Gradient Boosting 平均 AUC score: {auc:.2f}“) print(“综合混淆矩阵:”) print(total_confusion_matrix) pipeline.fit(X, y) test_data = pd.read_excel(‘C:/lydata/Testtest1.xlsx’) X_test = test_data.drop(‘HER2_G’, axis=1) y_test = test_data[‘HER2_G’] y_test_pred = pipeline.predict(X_test) y_test_proba = pipeline.predict_proba(X_test)[:, 1] accuracy_test = accuracy_score(y_test, y_test_pred) precision_test = precision_score(y_test, y_test_pred) recall_test = recall_score(y_test, y_test_pred) f1_test = f1_score(y_test, y_test_pred) auc_test = roc_auc_score(y_test, y_test_proba) print(f"测试集 accuracy: {accuracy_test:.2f}”) print(f"测试集 precision: {precision_test:.2f}“) print(f"测试集 recall: {recall_test:.2f}”) print(f"测试集 F1 score: {f1_test:.2f}“) print(f"测试集 AUC score: {auc_test:.2f}”) 这个代码我想对特征进行更好的筛选,应该使用什么方法
<think>嗯,用户之前问过关于结合随机森林特征选择和RFE的问题,现在他们有一个具体的代码,想要进一步优化特征筛选的方法。我需要先仔细看看他们的代码结构,理解他们现在在做什么,然后找出可能改进的地方。
首先,用户加载了数据,划分了特征和目标变量HER2_G。然后使用KFold进行交叉验证,建立了一个包含SMOTE、TomekLinks、StandardScaler、RFE和GradientBoostingClassifier的Pipeline。RFE这里用的是随机森林作为基础模型,选择10个特征。最后在测试集上评估性能。
用户的问题是想对特征进行更好的筛选,应该用什么方法。之前的回答里提到过先随机森林重要性再RFE是否多此一举,但用户现在可能已经用了RFE,但效果可能不够好,或者想进一步优化。
首先,我要考虑他们的流程是否合理。比如,RFE在Pipeline里,是在数据预处理之后进行的,这样可能更好,因为特征选择应该放在过采样和标准化之后?或者过采样可能引入噪声,是否应该先做特征选择?这里可能需要调整步骤顺序。
另外,他们现在用的RFE是基于随机森林的,可能可以尝试不同的基模型,或者结合其他特征选择方法。比如先用方差阈值或互信息法过滤无关特征,减少RFE的计算量。或者使用SelectFromModel结合随机森林的重要性,再进行RFE,这样分阶段筛选。
还有,他们是否评估了当前RFE选出的特征是否最优?比如n_features_to_select=10是随意定的还是通过交叉验证确定的?可能需要用RFECV来自动选择最佳特征数。
另外,特征选择应该在交叉验证的每个fold中进行,避免数据泄露。用户现在的Pipeline在交叉验证的循环里,所以RFE是在每个训练集上独立进行的,这点是对的。但可能需要检查是否有其他泄露。
用户的Pipeline里用了SMOTE和TomekLinks来处理不平衡数据,但特征选择是否考虑了类别不平衡?比如随机森林的class_weight是balanced,但RFE的特征重要性是否受类别影响?可能需要用适合不平衡数据的方法。
可能的改进方法包括:调整特征选择步骤的顺序,使用更自动化的特征数量选择,结合多种特征选择方法,或者使用嵌入法如Lasso、梯度提升树内置的特征重要性。此外,是否应该将特征选择放在过采样之前或之后也需要考虑,因为过采样可能改变特征分布。
另外,用户现在用的是梯度提升分类器,是否可以利用其内置的特征重要性来进行筛选,或者在Pipeline中加入更多的特征选择步骤?
总结来说,可能的建议是:1)使用RFECV确定最佳特征数;2)结合过滤法和包裹法,如先方差阈值或互信息,再用RFE;3)调整特征选择在Pipeline中的位置;4)尝试不同的基模型进行RFE;5)利用集成特征重要性方法;6)验证特征选择的稳定性。
需要确保这些建议具体可行,并且能整合到用户的现有代码中。同时,要提醒用户注意过拟合风险,特别是在使用多次特征选择时,以及交叉验证的正确实施。</think>### 逐步优化建议:
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#### **1. 当前代码特征筛选存在的问题**
- **RFE固定选择10个特征**:`n_features_to_select=10`未通过验证确定,可能导致欠拟合或过拟合。
- **特征选择与数据预处理顺序**:SMOTE过采样在特征筛选之前执行,可能引入噪声特征干扰筛选结果。
- **单一筛选方法依赖**:仅依赖随机森林的RFE,未结合其他筛选策略。
---
#### **2. 改进方法及代码实现**
##### **方法1:动态确定最优特征数量(RFECV)**
```python
from sklearn.feature_selection import RFECV
# 替换原有 RFE
rfe = RFECV(
estimator=rf,
step=1,
cv=5, # 交叉验证折数
scoring='roc_auc', # 选择评估指标
min_features_to_select=5 # 最少保留特征数
)
# 更新 Pipeline
pipeline = Pipeline([
('smote', SMOTE(k_neighbors=1, sampling_strategy=0.8, random_state=42)),
('tomek', TomekLinks()),
('scaler', StandardScaler()),
('rfe', rfe),
('gb', GradientBoostingClassifier(...))
])
```
##### **方法2:多阶段特征筛选(过滤法 + 包裹法)**
```python
from sklearn.feature_selection import VarianceThreshold, SelectKBest, mutual_info_classif
# 第一阶段:过滤低方差特征
var_threshold = VarianceThreshold(threshold=0.1) # 删除方差 <0.1 的特征
# 第二阶段:互信息法筛选
mutual_info = SelectKBest(score_func=mutual_info_classif, k=20) # 保留Top 20特征
# 更新 Pipeline
pipeline = Pipeline([
('var_threshold', var_threshold),
('mutual_info', mutual_info),
('smote', SMOTE(...)),
('tomek', TomekLinks()),
('scaler', StandardScaler()),
('rfe', RFE(rf, n_features_to_select=10)),
('gb', GradientBoostingClassifier(...))
])
```
##### **方法3:集成多模型特征重要性**
```python
from sklearn.linear_model import LogisticRegression
from sklearn.feature_selection import SelectFromModel
# 使用随机森林和逻辑回归联合筛选
rf_selector = SelectFromModel(rf, threshold="median") # 中位数重要性阈值
lr_selector = SelectFromModel(LogisticRegression(penalty='l1', solver='liblinear'), max_features=15)
pipeline = Pipeline([
('smote', SMOTE(...)),
('tomek', TomekLinks()),
('scaler', StandardScaler()),
('rf_select', rf_selector),
('lr_select', lr_selector),
('gb', GradientBoostingClassifier(...))
])
```
---
#### **3. 关键调整点说明**
| **调整项** | **作用** | **注意事项** |
|-------------------------|--------------------------------------------------------------------------|----------------------------------------------------------------------------|
| **RFECV替代RFE** | 自动选择最优特征数量 | 计算成本较高,适合特征量中等(<500) |
| **预处理与筛选顺序调整** | 先做基本过滤(如方差阈值)再执行过采样,减少噪声干扰 | 需验证过采样是否应在筛选之后(某些场景过采样需依赖完整特征空间) |
| **多模型联合筛选** | 缓解单一模型偏差,例如:线性模型(Lasso)捕捉线性关系,树模型捕捉非线性 | 可能增加特征冲突,需通过交叉验证评估稳定性 |
---
#### **4. 效果验证方法**
```python
# 对比不同筛选方法的效果
from sklearn.model_selection import cross_validate
methods = [pipeline1, pipeline2, pipeline3] # 不同特征筛选策略的pipeline
for method in methods:
scores = cross_validate(
method, X, y,
cv=5,
scoring=['accuracy', 'f1', 'roc_auc'],
return_train_score=True
)
print(f"Method {method}: Test AUC = {np.mean(scores['test_roc_auc']):.3f}")
```
---
### 总结
1. **优先使用RFECV**动态确定特征数量,避免主观设定`n_features_to_select`。
2. **分阶段筛选**(过滤法→包裹法)可提升效率,例如:先用方差阈值或互信息粗筛,再用RFE精筛。
3. **调整预处理顺序**:若数据高维(如>100特征),建议先做基本过滤再执行过采样。
4. **多模型集成筛选**适用于对模型鲁棒性要求高的场景,但需平衡计算成本。
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