def save2txt(path, savepath='labels.txt'): print(os.path.exists(path)) with open(savepath, 'w') as t: imgfiles = glob.iglob(os.path.join(path, '**/*.tif'), recursive=True) for imgfile in imgfiles: imgname = os.path.split(imgfile)[-1] label = 0 if 'OK' in imgfile else 1 # label = 0 if imgfile.split('/')[-2] == 'OK' else 1 t.write(imgname + '\t' + str(label) + '\n') t.close()
时间: 2023-04-11 15:01:30 浏览: 140
这是一个Python函数,名为save2txt,它有两个参数:path和savepath。path是一个文件夹路径,savepath是一个可选参数,表示保存标签的文件路径,默认为'labels.txt'。
函数的作用是遍历path文件夹下所有的.tif文件,并将它们的标签保存到savepath文件中。如果.tif文件名中包含'OK',则标签为0,否则标签为1。
相关问题
我在看一段python代码,你可以从def generateds(path, txt):开始解释一下每行代码的意思吗 import tensorflow as tf from PIL import Image import numpy as np import os train_path = './fashion_image_label/fashion_train_jpg_60000/' train_txt = './fashion_image_label/fashion_train_jpg_60000.txt' x_train_savepath = './fashion_image_label/fashion_x_train.npy' y_train_savepath = './fashion_image_label/fahion_y_train.npy' test_path = './fashion_image_label/fashion_test_jpg_10000/' test_txt = './fashion_image_label/fashion_test_jpg_10000.txt' x_test_savepath = './fashion_image_label/fashion_x_test.npy' y_test_savepath = './fashion_image_label/fashion_y_test.npy' def generateds(path, txt): f = open(txt, 'r') contents = f.readlines() # 按行读取 f.close() x, y_ = [], [] for content in contents: value = content.split() # 以空格分开,存入数组 img_path = path + value[0] img = Image.open(img_path) img = np.array(img.convert('L')) img = img / 255. x.append(img) y_.append(value[1]) print('loading : ' + content) x = np.array(x) y_ = np.array(y_) y_ = y_.astype(np.int64) return x, y_
<think>嗯,用户让我解释从def generateds(path, txt)开始的每行代码。首先,我需要仔细看一下整个函数的代码结构,确保我理解每一行的作用。
首先,函数定义是def generateds(path, txt):,这个函数的名字是generateds,可能代表generate dataset,用来生成数据集。参数是path和txt,path应该是图片的路径,而txt是包含图片文件名和标签的文本文件路径。
接下来,函数内部打开文件:f = open(txt, 'r'),然后用readlines()按行读取内容,关闭文件。这一步是为了获取每一行的数据,每行可能对应一个图片的文件名和标签。
然后初始化x和y_作为空列表,用来存储图像数据和标签。循环处理contents中的每一行,用split()按空格分割,得到value数组,其中value[0]应该是图片文件名,value[1]是标签。img_path由path和value[0]拼接而成,可能需要注意路径是否正确,比如是否需要添加斜杠。
接着用PIL的Image.open打开图片,转换为灰度图('L'模式),再转成numpy数组。之后归一化到0-1之间,除以255。将处理后的图像数据添加到x列表,标签添加到y_列表,并打印加载信息。
循环结束后,将x和y_转换为numpy数组,并将y_的数据类型转换为int64,最后返回这两个数组。这里需要注意y_的astype转换是否正确,特别是标签是否为整数类型。
用户可能在使用这个函数生成训练集和测试集的数据,用于TensorFlow模型训练。需要检查路径是否正确,比如train_path和train_txt是否存在,是否有权限访问这些文件。另外,生成的npy文件保存路径是否正确,可能在后续代码中被加载使用。
可能的问题包括:文件路径错误导致无法读取图片或txt文件,图片格式不一致导致转换出错,标签是否为整数,或者归一化是否正确。另外,打印的loading信息是否过多,可能影响性能,但在调试阶段有帮助。
用户可能需要了解每行代码的作用,以便根据实际情况调整,比如修改图像处理步骤,调整路径,或者处理不同的数据格式。需要确保解释清楚每个步骤的目的,帮助用户理解数据预处理流程,以及如何将图像和标签转换为模型可用的格式。</think>好的,我来帮你逐步解析这个生成数据集的函数代码(从`def generateds(path, txt):`开始):
$$ 函数框架 $$
```python
def generateds(path, txt):
# 文件操作部分
f = open(txt, 'r') # 打开存储图片路径和标签的文本文件
contents = f.readlines() # 读取所有行(每行格式如:"image.jpg 3")
f.close()
# 数据容器初始化
x, y_ = [], [] # x存图像数据,y_存标签
# 遍历处理每张图片
for content in contents:
value = content.split() # 分割字符串(结果如:["image.jpg", "3"])
img_path = path + value[0] # 拼接完整图片路径(注意原代码可能需要加"/")
# 图像处理流程
img = Image.open(img_path) # 读取图片
img = np.array(img.convert('L')) # 转灰度图并转换为numpy数组
img = img / 255. # 归一化到[0,1]范围
# 数据收集
x.append(img) # 添加处理后的图像数据
y_.append(value[1]) # 添加标签
print('loading : ' + content) # 显示加载进度
# 数据格式转换
x = np.array(x) # 转换为numpy数组(shape:[样本数, 高, 宽])
y_ = np.array(y_) # 转换为numpy数组(标签数组)
y_ = y_.astype(np.int64) # 将标签转为整型(适合分类任务)
return x, y_ # 返回图像数据和标签
```
$$ 关键步骤说明 $$
1. **路径处理**:
- `path`参数指向图片存储目录(如`./fashion_train_jpg_60000/`)
- `txt`参数指定的文本文件包含文件名与标签的映射关系(每行格式:`图片名 标签`)
2. **图像预处理**:
- 使用`convert('L')`将图片转为灰度图(若需保留颜色应改为`'RGB'`)
- 归一化操作`/255.`将像素值映射到0-1范围,这是神经网络输入的常见预处理
3. **数据类型转换**:
- 最后将列表转为numpy数组是为了提高数据处理效率
- 标签强制转换为`np.int64`是因为TensorFlow分类任务通常需要整型标签
$$ 典型应用场景 $$
通过后续代码可以看到:
```python
if not os.path.exists(x_train_savepath):
x_train, y_train = generateds(train_path, train_txt)
x_test, y_test = generateds(test_path, test_txt)
# 保存生成的numpy数组...
```
这个函数用于将图像数据集转换为更高效的numpy二进制格式存储,避免每次训练时重复进行文件IO和预处理。
$$ 注意事项 $$
1. **路径拼接问题**:原代码`path + value[0]`存在潜在问题,如果`path`不以`/`结尾且文件名不以`/`开头,可能导致路径错误。建议改为`os.path.join(path, value[0])`
2. **灰度转换选择**:`convert('L')`将丢失颜色信息,若处理彩色数据集需要修改为`convert('RGB')`
3. **内存限制**:当处理6万张图片时(如fashion数据集),直接存入内存可能造成内存溢出,实际生产环境建议使用`tf.data.Dataset`的生成器方式
需要特别注意打印语句`print('loading...')`在大规模数据集处理中会影响性能,建议调试时使用,正式运行时移除。
给出相同功能的代码import os import numpy as np import nibabel as nib import imageio from PIL import Image def read_niifile(niifilepath): # 读取niifile文件 img = nib.load(niifilepath) # 提取niifile文件 img_fdata = img.get_fdata(dtype='float32') return img_fdata def save_fig(niifilepath, savepath, num, name): # 保存为图片 name = name.split('-')[1] filepath_seg = niifilepath + "segmentation\" + "segmentation-" + name filepath_vol = niifilepath + "volume\" + "volume-" + name savepath_seg = savepath + "segmentation\" savepath_vol = savepath + "volume\" if not os.path.exists(savepath_seg): os.makedirs(savepath_seg) if not os.path.exists(savepath_vol): os.makedirs(savepath_vol) fdata_vol = read_niifile(filepath_vol) fdata_seg = read_niifile(filepath_seg) (x, y, z) = fdata_seg.shape total = x * y for k in range(z): silce_seg = fdata_seg[:, :, k] if silce_seg.max() == 0: continue else: silce_seg = (silce_seg - silce_seg.min()) / (silce_seg.max() - silce_seg.min()) * 255 silce_seg = np.uint8(Image.fromarray(silce_seg).convert('L')) silce_seg = cv2.threshold(silce_seg, 1, 255, cv2.THRESH_BINARY)[1] if (np.sum(silce_seg == 255) / total) > 0.015: silce_vol = fdata_vol[:, :, k] silce_vol = (silce_vol - silce_vol.min()) / (silce_vol.max() - silce_vol.min()) * 255 silce_vol = np.uint8(Image.fromarray(silce_vol).convert('L')) imageio.imwrite(os.path.join(savepath_seg, '{}.png'.format(num)), silce_seg) imageio.imwrite(os.path.join(savepath_vol, '{}.png'.format(num)), silce_vol) num += 1 return num if name == 'main': path = r'C:\Users\Administrator\Desktop\LiTS2017' savepath = r'C:\Users\Administrator\Desktop\2D-LiTS2017' filenames = os.listdir(path + "segmentation") num = 0 for filename in filenames: num = save_fig(path, savepath, num, filename)
这段代码实现了将NIfTI格式的医学图像数据转换为2D图像进行保存的功能。具体来说,它首先读取NIfTI格式的图像文件,并提取图像数据。然后,它将图像数据转换为灰度图像,并通过二值化处理将分割标签提取出来,最后将分割标签和对应的图像保存为PNG格式的文件。
这个代码和你之前给出的代码实现了相同的功能,但是具体实现细节有所不同。例如,它使用了PIL库和imageio库来保存图像文件,而你之前使用的是cv2库。此外,它使用了numpy库和nibabel库来读取和处理NIfTI格式的图像数据,而你之前使用的是SimpleITK库。
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