写一段代码 要求能用PyQt结合VTK读取指定的.dcm序列文件,将其转换成.nii.gz文件并做三维可视化

时间: 2024-05-01 20:16:14 浏览: 241
以下是示例代码: ```python import vtk import numpy as np import SimpleITK as sitk from PyQt5.QtWidgets import QApplication, QWidget, QFileDialog, QVBoxLayout from vtk.qt.QVTKRenderWindowInteractor import QVTKRenderWindowInteractor class DicomViewer(QWidget): def __init__(self): super().__init__() # 创建VTK渲染窗口 self.vtkWidget = QVTKRenderWindowInteractor(self) self.vtkWidget.Initialize() self.vtkWidget.Start() # 创建PyQt布局 layout = QVBoxLayout() layout.addWidget(self.vtkWidget) self.setLayout(layout) # 设置窗口标题和大小 self.setWindowTitle('Dicom Viewer') self.setGeometry(100, 100, 800, 600) # 打开.dcm序列文件 options = QFileDialog.Options() options |= QFileDialog.DontUseNativeDialog fileName, _ = QFileDialog.getOpenFileName(self, "Open DICOM Directory", "", "DICOM Files (*.dcm)", options=options) if fileName: # 读取.dcm序列文件 reader = vtk.vtkDICOMImageReader() reader.SetDirectoryName(fileName) reader.Update() # 获取图像数据 imageData = reader.GetOutput() # 将VTK图像数据转换成SimpleITK图像数据 sitkImage = sitk.GetImageFromArray(vtk.util.numpy_support.vtk_to_numpy(imageData.GetPointData().GetScalars()).reshape( imageData.GetDimensions()[::-1]).transpose()) sitkImage.SetSpacing(imageData.GetSpacing()[::-1]) # 保存为.nii.gz文件 sitk.WriteImage(sitkImage, 'output.nii.gz') # 创建VTK渲染器和窗口 renderer = vtk.vtkRenderer() self.vtkWidget.GetRenderWindow().AddRenderer(renderer) # 创建VTK图像数据显示对象 mapper = vtk.vtkImageMapper() mapper.SetInputData(imageData) actor = vtk.vtkActor2D() actor.SetMapper(mapper) # 将VTK图像数据显示对象添加到VTK渲染器中 renderer.AddActor(actor) renderer.ResetCamera() if __name__ == '__main__': app = QApplication([]) window = DicomViewer() window.show() app.exec_() ``` 这段代码可以在PyQt界面中打开.dcm序列文件,并将其转换为.nii.gz文件。同时,它还使用VTK进行三维可视化,并将VTK渲染窗口嵌入到PyQt界面中。您可以根据需要对代码进行修改。
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