科学家使用DL和其他工具预测2019年新型冠状病毒宿主和传染性

研究揭示2019-nCoV在2019年12月中旬可能已开始人际传播,基本繁殖数量估计为2.2。中国疾控中心等机构通过分析数据,强调监测疫情并寻找有效控制措施。机器学习和深度学习算法用于疫情分析,揭示与蝙蝠和水貂关联的可能性。

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一项新的研究表明,2019年新型冠状病毒(2019-nCoV)的人与人之间的传播可能早在2019年12月中旬就开始了。这些发现与武汉市卫生健康委员会在12月底或1月初的声明相矛盾,即“没有发现2019-nCoV在人与人之间传播的重要证据”。

这项研究昨天发表在著名的同行评审医学杂志《新英格兰医学杂志》(NEJM)上,由中国疾病预防控制中心、中国各省市疾病预防控制中心以及多家研究机构的研究人员发表。NEJM强调,“本文中表达的观点是作者的观点,不代表中国疾控中心的官方政策。

2019年12月,中国湖北省武汉市华南海鲜批发市场出现了最近新型冠状病毒感染的肺炎的最初病例。研究人员分析了武汉首批425例确诊病例的数据,估计2019-nCoV的基本繁殖数量约为2.2。

基本生殖数或R0表示一个病例在其感染期内在未感染人群中平均产生的病例数。R0大于1意味着感染将能够在人群中传播。

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研究人员表示,控制疫情的努力应包括密切监测,以确定减少社区传播的有效措施,并观察流行病学的任何变化 - 例如,年轻人群或卫生保健工作者的感染增加。

中国和世界各地的许多其他研究团队也发表了分析疫情传播的论文,其中一些人应用机器学习算法来协助他们的分析。

上周,北京大学和浙江大学医学院第一附属医院的研究人员在bioRxiv上发表了《使用深度学习算法预测武汉2019新型冠状病毒的宿主和感染性》,这表明2019-nCoV的感染模式与2003年的严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV)非常相似,其他蝙蝠SARS样冠状病毒WIV1和2012年中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV)。

由于2019-nCoV的传染性模式也与水貂病毒非常相似,研究人员确定蝙蝠和水貂是2019-nCo病毒的两个主要候选宿主。

研究得出了一系列2019-nCov R0的估计值。中国广东省疾病预防控制中心使用指数增长和最大似然估计估计R0为2.9,香港大学的一个团队预测R0为2.13,伦敦帝国理工学院最近的R0估计为2.6。

其他研究正在进行中,以进一步改善2019-nCoV R0和宿主预测。Synced正在密切关注此主题,并将在新信息可用时继续更新读者。

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