Si Ferdinand Magellan ay nakilala sa kanyang ekspedisyon na nagpapatunay na ang Asya ay maaaring maabot gamit ang pakanlurang ruta. Sa mga kasunod na ekspedisyon, si Miguel Lopez de Legazpi ang matagumpay na sumakop sa Pilipinas at itinatag ang pamahalaang kolonyal, kasama na ang pagbuo ng Intramuros bilang sentro ng pamahalaan. Ang ekspedisyong Villalobos ay nagbigay pangalan sa bansa bilang 'Las Islas Filipinas' bilang parangal kay Haring Felipe II.