「小技巧」R语言如何读取复制的文本

本文探讨了在R语言中优雅地读取和处理基因列表的方法,包括从剪切板读取、使用strsplit和textConnection函数,以及如何将数据转换为数据库格式。

摘要生成于 C知道 ,由 DeepSeek-R1 满血版支持, 前往体验 >

有一种场景是,你读文章的文章的时候,发现有一段内容是

monocyte-specific genes (that is, CD14, CSF1R, TREML4)

你打算新建一个对象,叫做mono_gene,存放三个标记基因。之前我的做法有两种,一种是新建一个文本,里面存放的就是三个基因,然后用read.table读取。第二种是mono_gene <- c("CD14","CSF1R","TREML4")

这两种方法都不够优雅,我在想能不能读取剪切板里的内容呢?我通过搜索找到了方法,read.table(file = "clipboard", sep = "\t", header=TRUE),但是这不够优雅,谁知道你的clipboard里到底是啥内容呢。

目前我认为能用的方法是

mono_gene <- unlist(strsplit("CD14, CSF1R, TREML4", split = ",", fixed = T))
mono_gene <- gsub(" ", "", mono_gene)

不过只能适合读取向量,如果想读取成数据库,更好的方法是利用函数textConnection

tmp <- "a   b   c   d
1   1   1   B
2   1   2   C
3   1   3   C
4   1   4   C
5   1   5   B
6   1   6   B
7   1   7   C
8   1   8   A
9   1   9   B
10  1   10  C
"
df <- read.table(textConnection(object = tmp),sep="\t", header = T)

textConnection的功能是构建一个文本输入对象, Connection, 而Connection则能被read.table等函数接受。

评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值