bamcut v0.1.0

bamcut 是一个用于从 BAM 文件中提取指定区域的序列并生成 FASTQ 文件的工具。

特性

• 提取指定基因组区域的 reads
• 支持生成压缩的 FASTQ 文件
• 基于 Rust 实现，性能高效

发布说明

这是 bamcut 的首个发布版本，提供两种构建版本：

1. GNU版本 (bamcut-v0.1.0-x86_64-unknown-linux-gnu)

   • 依赖系统glibc库
   • 性能优化更好
   • 适用于大多数现代Linux发行版

2. MUSL版本 (bamcut-v0.1.0-x86_64-unknown-linux-musl)

   • 静态链接，无系统依赖
   • 可在任何Linux系统上运行
   • 适用于容器环境或老旧系统

使用方法

bamcut -i <input.bam> -o <output.fq.gz> -r <chrom:start-end>